Die Zimmer sind weiß, wie auch die anderen Abschnitte des Hotels, sie sind jedoch frei von den barocken Elementen, die den Empfangsbereich prägen. Die Beschränkung auf nur neun Zimmer ist Teil des Bestrebens des Hotels, ein einzigartiger Ort für Luxusurlaube zu bleiben. Ohne das Dekor an dieser Stelle in allen Details beschreiben zu wollen, ist hier sofort spürbar, dass ein Aufenthalt im La Maltese eine sensorisch bereichernde Erfahrung ist: Die eleganten, in die für Imerovigli so typische Ruhe getauchten Zimmer verströmen einen Duft nach Holz, der diesem Ort eine zeitlose Dimension verleiht und verstärkt wird durch das gleißende Mittagslicht, das von weißen Markisen gefiltert in den Raum fällt.
Die Wände der doppelten Superior-Zimmer schmückt ein zeitloser Wandbehang und auf dem alten stilechten Bett liegt eine weiße Bettdecke: Nachts wird es in den Zimmern kühler und die Temperaturen können im Winter aufgrund des starken Windes in der Caldeira regelrecht eisig sein. Die Zimmer der Superior-Kategorie sind in den Fels gearbeitet, erweisen sich jedoch als geräumiger als die Superior Doppel-Zimmer. Für ein ästhetisches Innenleben sorgen weiße Schränke und ein Baldachin-Bett. Bei der Konzipierung des vom Wohnraum getrennten Bades mit seinen Holzarbeiten wurden die weiblichen Gäste nicht vergessen und die bereitgestellten Pflegeprodukte beinhalten sogar Wattepads.
Alle Zimmer verfügen über Klimaanlage, Schränke sowie einen Zimmerservice auf Anfrage. Das Frühstück ist im Preis enthalten.