Von allen maltesischen Kirchen (und es hat dort nicht weniger als 350) ist die St. John Kathedrale ohne Zweifel jene mit der prächtigsten Dekoration. Hoch-Reliefs aus behauenem Marmor, erhöhte Friese aus feinem Gold, mit Medaillons und Fresken verzierte Gewölbe, die die Symbole des Ordens sowie verschiedene religiöse Szenen darstellen. Beiderseits vom Kirchenschiff befinden sich acht Kapellen, jede ist einer der acht Sprachen des Ordens gewidmet (englisch, provenzalisch, französisch, italienisch, deutsch, auvergnat, aragonisch und kastilisch). Ihr barocker Stil bietet Reichtum und Fülle an. Ein Ensemble, das sehr lebhaft mit der Außenseite der Kathedrale kontrastiert, deren nüchterne Fassade aus Kalkstein von der Insel kaum von einigen Profilleisten erhöht wird.