Das Museo San Marco ist in einem ehemaligen Kloster untergebracht, das Teil eines ganzen religiösen Komplexes ist, der dem Heiligen Markus gewidmet ist. In einer seiner Zellen lebte im 15. Jahrhundert einer der berühmtesten Mönche der Kunstgeschichte, Fra Angelico. Dieser außergewöhnlich begabte Mönch wird in den Sammlungen des Museo San Marco geehrt.
Sein berühmtestes Werk ist die Verkündigung, ein Meisterwerk der Renaissance, das um 1440 entstand und das Herzstück des Museums ist.
Weitere Gemälde von Fra Angelico sowie Fresken, die beispielsweise die ehemaligen Mönchszellen schmücken, sind ebenfalls ausgestellt. Weitere große Künstler der Epoche sind in den Galerien des Museo San Marco ausgestellt, ein wahrer Leckerbissen für Malereispezialisten und -liebhaber gleichermaßen.