Da Formentera keinen Flughafen hat, ist die einzige Möglichkeit, die Insel zu erreichen, das Schiff. Mehrere Schifffahrtsgesellschaften wie Aquabus Ferry Boats, Trasmapi oder Mediterranea Pitiusa bieten Überfahrten von Ibiza-Stadt zum Hafen von La Savina an. Von Mai bis Oktober gibt es alle 20 bis 30 Minuten Abfahrten (von November bis April sind sie weniger regelmäßig). Die Preise variieren zwischen 15 und 27 Euro.
In einigen Badeorten wie Sant Antoni oder Santa Eulària werden auch ganztägige Bootsausflüge organisiert. Sie können auch Ihr eigenes Boot mit oder ohne Skipper mieten, um mehr Privatsphäre und Freiheit zu genießen.